科技日報北京4月8日電 （記者張夢(mèng)然）最新發(fā)表在《自然·機器智能》上的一篇論文中，美國普林斯頓大學(xué)研究人員詳細介紹了一種語(yǔ)言模型，該模型可追蹤部分基因組序列并優(yōu)化這些序列，利用其語(yǔ)義表示能力來(lái)設計更有效的信使RNA（mRNA）疫苗。
新模型的代碼包含所有生命功能的指令?；蚪M中每個(gè)序列都遵循復雜的語(yǔ)法和句法，這些結構產(chǎn)生了意義。正如改變幾個(gè)單詞可從根本上改變句子含義，生物序列的微小變化也可使序列編碼產(chǎn)生巨大差異。
科學(xué)家將遺傳信息的流動(dòng)總結為“生物學(xué)中心法則”：信息從DNA轉移到RNA再到蛋白質(zhì)，蛋白質(zhì)創(chuàng )造活細胞的結構和功能。mRNA在最后一步（稱(chēng)為翻譯）將信息轉化為蛋白質(zhì)。mRNA只有一部分包含蛋白質(zhì)代碼，其余部分不進(jìn)行翻譯，但控制翻譯過(guò)程的重要方面。
控制蛋白質(zhì)生產(chǎn)效率是mRNA疫苗發(fā)揮作用的關(guān)鍵機制。在對少數物種進(jìn)行模型訓練后，研究人員生成了數百個(gè)新的優(yōu)化序列，并通過(guò)實(shí)驗驗證了這些結果。最佳序列的性能優(yōu)于疫苗開(kāi)發(fā)的多個(gè)領(lǐng)先基準，其中蛋白質(zhì)生產(chǎn)的整體效率提高了33%。
研究團隊使用經(jīng)過(guò)訓練的模型創(chuàng )建了包含211個(gè)新序列的庫，每個(gè)都針對所需功能進(jìn)行了優(yōu)化，提高了翻譯效率。這些蛋白質(zhì)，如新冠疫苗靶向的刺突蛋白，可驅動(dòng)針對傳染病的免疫反應。
新模型是第一個(gè)專(zhuān)注于mRNA非翻譯區域的語(yǔ)言模型。研究人員表示，即使是少量提高蛋白質(zhì)生產(chǎn)效率，也會(huì )對新興療法產(chǎn)生重大推動(dòng)作用。經(jīng)過(guò)對來(lái)自少數物種的mRNA的訓練，它能解碼核苷酸序列并揭示有關(guān)基因調控的新知識。而基因調控是生命最基本的功能之一，是找到疾病和紊亂根源的關(guān)鍵。
【總編輯圈點(diǎn)】
我們喜歡問(wèn)語(yǔ)言模型一大堆奇奇怪怪問(wèn)題，把它當成生活和工作的助手。然而，語(yǔ)言模型還能在制造疫苗中大顯身手。因為，在生物世界，同樣有信息流動(dòng)，同樣有語(yǔ)言和語(yǔ)法。mRNA被稱(chēng)為信使RNA，指導蛋白質(zhì)合成。不過(guò)，它只有一部分包含蛋白質(zhì)代碼，還有一部分則不翻譯。語(yǔ)言模型就瞄準了這些未翻譯的部分，經(jīng)過(guò)訓練，提高了蛋白質(zhì)生產(chǎn)的效率，有助于研發(fā)更好的mRNA疫苗。機器智能與生物智能結合，創(chuàng )造出了更有意思的產(chǎn)品。
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